Der Bahnhof Bebra ist ein Knotenbahnhof im deutschen Personen- und Güterverkehrsnetz  und ist Verkehrsknotenpunkt mehrerer Eisenbahnstrecken in alle Richtungen (Frankfurt, Fulda, Kassel, Göttingen, Eisenach, Bad Hersfeld) sowie Halt einzelner Intercity-Züge der Mitte-Deutschland-Verbindung zwischen Düsseldorf und Leipzig/Dresden. Zudem ist er einer der wichtigsten Bahnhöfe im Nahverkehr (gemeinsam mit Kassel der wichtigste in Nord-/Ost-Hessen), da er das Schienenkreuz der NVV-Cantus-Linien bildet.
Aufgrund des Schienenkreuzes, mit dem Pendler aus allen Himmelsrichtungen nach Bebra gelangen, ist er bereits heute der leistungsfähigste Bahnhof im Landkreis Hersfeld-Rotenburg und zentraler Knotenpunkt des ÖPNV.